Posted by on 1 lipca 2019

W swoich badaniach nad korelacją między alleliczną utratą chromosomu 18q a przeżyciem wśród pacjentów z rakiem jelita grubego (wydanie z 28 lipca), Jen et al. wykorzystał polimorfizmy mikrosatelitarne do rozróżnienia dwóch alleli w DNA guza. Względna intensywność dwóch alleli w DNA nowotworu różniących się od względnej intensywności w nienowotworowym tkankowym DNA o współczynnik co najmniej 1,5 była stosowana jako kryterium utraty heterozygotyczności. Jednakże to kryterium nie jest wystarczająco rygorystyczne, aby wspierać utratę heterozygotyczności w niektórych przypadkach raka wątroby.
Zastosowaliśmy 12 markerów mikrosatelitarnego polimorfizmu do amplifikacji chromosomu 1p w 30 parach próbek tkanki wątrobowokomórkowej i nienowotworowej tkance wątrobowej. W dziewięciu parach różnica w stosunku allelicznym była większa niż 6 dla kilku kolejnych markerów, a utrata heterozygotyczności została następnie potwierdzona przez analizę Southern blot. Stwierdzono różnicę 2 lub 3 w stosunku dla kilku kolejnych markerów w sześciu innych parach próbek. Jednak analiza Southern blot DNA z tych tkanek ujawniła dwukrotne lub trzykrotne zwiększenie liczby kopii jednego allelu, zamiast utraty innego allelu.3 W tych sześciu raku wątrobowokomórkowym możliwe było powielenie lub namnażanie w chromosomie 1, jak pokazano dla chromosom 8 w nowotworach wątroby w innym badaniu.4 Próbki guza w pozostałych parach miały te same współczynniki alleliczne.
Chociaż kryterium przyjęte przez Jen et al. jest niezawodny w wykrywaniu braku równowagi w dawkowaniu genów między dwoma allelami w DNA nowotworu, nie rozróżnia utraty jednego allelu od zwiększonej liczby kopii innego allelu. Określenie utraty heterozygotyczności przez polimorfizmy mikrosatelitarne powinno zatem spełniać bardziej rygorystyczne kryterium, takie jak różnica w stosunku allelicznym o współczynnik wynoszący co najmniej 3. O ile nie istnieje potwierdzenie niezależnymi metodami, różnica we współczynniku allelicznym, który nie jest większe niż 3 należy sklasyfikować jako ustalenie nieokreślone, a nie jako wyraźne dowody utraty heterozygotyczności, a takie przypadki należy wykluczyć z analizy prognostycznej.
Pei-Jer Chen, MD, Ph.D.
Shiou-Hwei Yeh, MS
Ding-Shinn Chen, MD
National Taiwan University Hospital, Taipei, Tajwan 10016
4 Referencje1. Jen J, Kim H, Piantadosi S, i in. Allelowa utrata chromosomu 18q i rokowanie w raku jelita grubego. N Engl J Med 1994; 331: 213-221
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Gruis NA, Abeln EC, Bardoel AF, Devilee P, Frants RR, Cornelisse CJ. Oparte na PCR polimorfizmy mikrosatelitarne w wykrywaniu utraty heterozygotyczności w świeżej i archiwalnej tkance nowotworowej. Br J Cancer 1993; 68: 308-313
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
3. Yeh SH, Chen PJ, Chen HL, Lai MY, Wang CC, Chen DS. Częste zmiany genetyczne w dystalnym regionie chromosomu 1p w ludzkich wątrobowokomórkowych nowotworach. Cancer Res 1994; 54: 4188-4192
Web of Science MedlineGoogle Scholar
4. Fujiwara Y, Monden M, Mori T, Nakamura Y, Emi M. Częste powielanie długiego ramienia chromosomu 8 w raku wątrobowokomórkowym Cancer Res 1993; 53: 857-860
Web of Science MedlineGoogle Scholar
Jen i in. wykorzystać alleliczną utratę chromosomu 18q do przewidywania przerzutów w raku jelita grubego. Utrata alleli jest doskonałym predyktorem, który pacjenci będą mieli odległe przerzuty (czułość 95 procent), ale słabym predyktorem, który pacjenci nie będą mieli odległych przerzutów (swoistość 52 procent). Tak więc utratę chromosomu 18q można wykorzystać do określenia potencjalnego przerzutowania, ale nie wykluczenia go. Pod względem terapii oznacza to, że osoby, które nie mają allelicznej utraty chromosomu 18q, nadal będą musiały być leczone tak, jakby były zagrożone przerzutami.
Harry B. Burke, MD, Ph.D.
University of Nevada School of Medicine, Reno, NV 89520
Odpowiedź
Autorzy odpowiadają:
Do redakcji: Zgadzamy się z Chenem i jego współpracownikami, że nierównowaga alleliczna określona przez reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) nie może odróżnić utraty jednego allelu od wzmocnienia drugiego. Jednak po znalezieniu markerów chromosomu 18q w raku jelita grubego, brak równowagi prawie zawsze odzwierciedla stratę. Opieramy tę interpretację na obszernym zestawie analiz typu Southern blot z sondami z każdego innego ramienia chromosomu jako kontroli1; w sprawie analizy cytogenetycznej2,3; oraz o ocenie heteroprzeszczepów, w których straty alleliczne są jednoznaczne z powodu braku zanieczyszczających nieneoplastycznych składników (dane niepublikowane).
Naszym zdaniem, testy oparte na PCR nie mogą w wiarygodny sposób rozróżnić między utratą a wzmocnieniem chromosomu, bez względu na stosunek alleliczny. W przypadku innych regionów chromosomalnych (takich jak opisane przez Chena i wsp.), Należy zastosować niezależne metody w celu określenia, czy straty lub przyrosty są typowo obecne, tak aby wyniki oznaczeń opartych na PCR można było odpowiednio interpretować. Należy również zauważyć, że nierównowaga alleli w testach opartych na PCR, niezależnie od tego, czy stanowią one straty, czy też zyski odpowiednich regionów chromosomalnych, może nadal być przydatnymi wskaźnikami prognostycznymi, ponieważ zakres nierównowagi może korelować ze stopniem aneuploidii.
W odpowiedzi na uwagi doktora Burke a, potencjalna kliniczna użyteczność utraty allelicznej chromosomu 18q musi być rozważona w kontekście stadium choroby. Stwierdziliśmy, że wśród pacjentów z rakiem II stadium brak allelicznej utraty chromosomu 18q w nowotworze był związany z pięcioletnim czasem przeżycia wynoszącym prawie 95 procent, podczas gdy pacjenci z nowotworami, którzy mieli alleliczną utratę chromosomu 18q, mieli pięcioletnie przeżycie. około 50 procent. Pacjenci z wysokim oczekiwanym czasem przeżycia raczej nie skorzystają z dalszej terapii, podczas gdy ci z gorszym rokowaniem mogą skorzystać z dalszej terapii. Badania są prowadzone przez współpracujące grupy onkologiczne w celu omówienia zastosowania terapii adjuwantowej w odniesieniu do markerów prognostycznych, w tym statusu chromosomu 18q.
Stanley R. Hamilton, MD
Jin Jen, Ph.D.
Bert Vogelstein, MD
Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD 21205-2196
3 Referencje1. Vogelstein B, Fearon ER, Kern SE, i in. Allelotype of colorectal carcinomas. Science 1989; 244: 207-211
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
2 Muleris M, Salmon RJ, Zafrani B, Girodet J, Dutrillaux B. Konsekwentne niedobory chromosomu 18 i krótkiego ramienia chromosomu 17 w 11 przypadkach raka jelita grubego u ludzi: możliwy recesywny determinizm. Ann Genet 1985; 28: 206-213
MedlineGoogle Scholar
3. Bardi G, Johansson B, Pandis N i in. Cytogenetyczne aberracje w gruczolakoraku jelita grubego i ich korelacje z c
[więcej w: etiaksil, orton flex saszetki, traktomix ]

  1. Zero Charisma
    19 stycznia 2019

    W efekcie okazało się, że to rzadki, złośliwy nowotwór

  2. Diana
    21 stycznia 2019

    [..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu skup ziół[…]

  3. Agnieszka
    23 stycznia 2019

    Nie wiem już co robić

Powiązane tematy z artykułem: etiaksil orton flex saszetki traktomix

Posted by on 1 lipca 2019

W swoich badaniach nad korelacją między alleliczną utratą chromosomu 18q a przeżyciem wśród pacjentów z rakiem jelita grubego (wydanie z 28 lipca), Jen et al. wykorzystał polimorfizmy mikrosatelitarne do rozróżnienia dwóch alleli w DNA guza. Względna intensywność dwóch alleli w DNA nowotworu różniących się od względnej intensywności w nienowotworowym tkankowym DNA o współczynnik co najmniej 1,5 była stosowana jako kryterium utraty heterozygotyczności. Jednakże to kryterium nie jest wystarczająco rygorystyczne, aby wspierać utratę heterozygotyczności w niektórych przypadkach raka wątroby.
Zastosowaliśmy 12 markerów mikrosatelitarnego polimorfizmu do amplifikacji chromosomu 1p w 30 parach próbek tkanki wątrobowokomórkowej i nienowotworowej tkance wątrobowej. W dziewięciu parach różnica w stosunku allelicznym była większa niż 6 dla kilku kolejnych markerów, a utrata heterozygotyczności została następnie potwierdzona przez analizę Southern blot. Stwierdzono różnicę 2 lub 3 w stosunku dla kilku kolejnych markerów w sześciu innych parach próbek. Jednak analiza Southern blot DNA z tych tkanek ujawniła dwukrotne lub trzykrotne zwiększenie liczby kopii jednego allelu, zamiast utraty innego allelu.3 W tych sześciu raku wątrobowokomórkowym możliwe było powielenie lub namnażanie w chromosomie 1, jak pokazano dla chromosom 8 w nowotworach wątroby w innym badaniu.4 Próbki guza w pozostałych parach miały te same współczynniki alleliczne.
Chociaż kryterium przyjęte przez Jen et al. jest niezawodny w wykrywaniu braku równowagi w dawkowaniu genów między dwoma allelami w DNA nowotworu, nie rozróżnia utraty jednego allelu od zwiększonej liczby kopii innego allelu. Określenie utraty heterozygotyczności przez polimorfizmy mikrosatelitarne powinno zatem spełniać bardziej rygorystyczne kryterium, takie jak różnica w stosunku allelicznym o współczynnik wynoszący co najmniej 3. O ile nie istnieje potwierdzenie niezależnymi metodami, różnica we współczynniku allelicznym, który nie jest większe niż 3 należy sklasyfikować jako ustalenie nieokreślone, a nie jako wyraźne dowody utraty heterozygotyczności, a takie przypadki należy wykluczyć z analizy prognostycznej.
Pei-Jer Chen, MD, Ph.D.
Shiou-Hwei Yeh, MS
Ding-Shinn Chen, MD
National Taiwan University Hospital, Taipei, Tajwan 10016
4 Referencje1. Jen J, Kim H, Piantadosi S, i in. Allelowa utrata chromosomu 18q i rokowanie w raku jelita grubego. N Engl J Med 1994; 331: 213-221
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Gruis NA, Abeln EC, Bardoel AF, Devilee P, Frants RR, Cornelisse CJ. Oparte na PCR polimorfizmy mikrosatelitarne w wykrywaniu utraty heterozygotyczności w świeżej i archiwalnej tkance nowotworowej. Br J Cancer 1993; 68: 308-313
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
3. Yeh SH, Chen PJ, Chen HL, Lai MY, Wang CC, Chen DS. Częste zmiany genetyczne w dystalnym regionie chromosomu 1p w ludzkich wątrobowokomórkowych nowotworach. Cancer Res 1994; 54: 4188-4192
Web of Science MedlineGoogle Scholar
4. Fujiwara Y, Monden M, Mori T, Nakamura Y, Emi M. Częste powielanie długiego ramienia chromosomu 8 w raku wątrobowokomórkowym Cancer Res 1993; 53: 857-860
Web of Science MedlineGoogle Scholar
Jen i in. wykorzystać alleliczną utratę chromosomu 18q do przewidywania przerzutów w raku jelita grubego. Utrata alleli jest doskonałym predyktorem, który pacjenci będą mieli odległe przerzuty (czułość 95 procent), ale słabym predyktorem, który pacjenci nie będą mieli odległych przerzutów (swoistość 52 procent). Tak więc utratę chromosomu 18q można wykorzystać do określenia potencjalnego przerzutowania, ale nie wykluczenia go. Pod względem terapii oznacza to, że osoby, które nie mają allelicznej utraty chromosomu 18q, nadal będą musiały być leczone tak, jakby były zagrożone przerzutami.
Harry B. Burke, MD, Ph.D.
University of Nevada School of Medicine, Reno, NV 89520
Odpowiedź
Autorzy odpowiadają:
Do redakcji: Zgadzamy się z Chenem i jego współpracownikami, że nierównowaga alleliczna określona przez reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) nie może odróżnić utraty jednego allelu od wzmocnienia drugiego. Jednak po znalezieniu markerów chromosomu 18q w raku jelita grubego, brak równowagi prawie zawsze odzwierciedla stratę. Opieramy tę interpretację na obszernym zestawie analiz typu Southern blot z sondami z każdego innego ramienia chromosomu jako kontroli1; w sprawie analizy cytogenetycznej2,3; oraz o ocenie heteroprzeszczepów, w których straty alleliczne są jednoznaczne z powodu braku zanieczyszczających nieneoplastycznych składników (dane niepublikowane).
Naszym zdaniem, testy oparte na PCR nie mogą w wiarygodny sposób rozróżnić między utratą a wzmocnieniem chromosomu, bez względu na stosunek alleliczny. W przypadku innych regionów chromosomalnych (takich jak opisane przez Chena i wsp.), Należy zastosować niezależne metody w celu określenia, czy straty lub przyrosty są typowo obecne, tak aby wyniki oznaczeń opartych na PCR można było odpowiednio interpretować. Należy również zauważyć, że nierównowaga alleli w testach opartych na PCR, niezależnie od tego, czy stanowią one straty, czy też zyski odpowiednich regionów chromosomalnych, może nadal być przydatnymi wskaźnikami prognostycznymi, ponieważ zakres nierównowagi może korelować ze stopniem aneuploidii.
W odpowiedzi na uwagi doktora Burke a, potencjalna kliniczna użyteczność utraty allelicznej chromosomu 18q musi być rozważona w kontekście stadium choroby. Stwierdziliśmy, że wśród pacjentów z rakiem II stadium brak allelicznej utraty chromosomu 18q w nowotworze był związany z pięcioletnim czasem przeżycia wynoszącym prawie 95 procent, podczas gdy pacjenci z nowotworami, którzy mieli alleliczną utratę chromosomu 18q, mieli pięcioletnie przeżycie. około 50 procent. Pacjenci z wysokim oczekiwanym czasem przeżycia raczej nie skorzystają z dalszej terapii, podczas gdy ci z gorszym rokowaniem mogą skorzystać z dalszej terapii. Badania są prowadzone przez współpracujące grupy onkologiczne w celu omówienia zastosowania terapii adjuwantowej w odniesieniu do markerów prognostycznych, w tym statusu chromosomu 18q.
Stanley R. Hamilton, MD
Jin Jen, Ph.D.
Bert Vogelstein, MD
Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD 21205-2196
3 Referencje1. Vogelstein B, Fearon ER, Kern SE, i in. Allelotype of colorectal carcinomas. Science 1989; 244: 207-211
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
2 Muleris M, Salmon RJ, Zafrani B, Girodet J, Dutrillaux B. Konsekwentne niedobory chromosomu 18 i krótkiego ramienia chromosomu 17 w 11 przypadkach raka jelita grubego u ludzi: możliwy recesywny determinizm. Ann Genet 1985; 28: 206-213
MedlineGoogle Scholar
3. Bardi G, Johansson B, Pandis N i in. Cytogenetyczne aberracje w gruczolakoraku jelita grubego i ich korelacje z c
[więcej w: etiaksil, orton flex saszetki, traktomix ]

  1. Zero Charisma
    19 stycznia 2019

    W efekcie okazało się, że to rzadki, złośliwy nowotwór

  2. Diana
    21 stycznia 2019

    [..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu skup ziół[…]

  3. Agnieszka
    23 stycznia 2019

    Nie wiem już co robić

Powiązane tematy z artykułem: etiaksil orton flex saszetki traktomix