Posted by on 16 czerwca 2018

Pierwotne przeciwciało wykrywano przy użyciu drugorzędowego przeciwciała (rozcieńczenie 1: 250 sprzężonego z peroksydazą chrzanową przeciwciała przeciwrakowego z kurczaka, sc-2984, Santa Cruz Biotechnology). Barwienie wizualizowano przy użyciu 3,3 -diaminobenzydyny (D4168, Sigma-Aldrich) i hematoksyliny jako kontrastu. Modelowanie TEX11
Serwer przewidywania struktury białek (PSIPRED), 15 serwerów homologii, wykrywania i prognozowania struktury (HHpred), 16 i serwer przewidywania struktury białka i funkcji (I-TASSER) 17 zastosowano do przewidywania struktury drugorzędowej białka. Wykorzystaliśmy bazę danych Pfam18 do wyszukania domen białkowych w TEX11. Metodę TPRpred19 zastosowano do identyfikacji regionów powtórzeń tetratricopeptide (TPR) w białku. Aby zwizualizować trójwymiarową strukturę TEX11, zastosowaliśmy algorytmy Phyre215 i I-TASSER.17,20 Modele konstrukcyjne wygenerowano za pomocą systemu Molecular Graphics System (Schröding er) firmy PyMOL (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku).
Wyniki
Badanie genetyczne aCGH
Tabela 1. Tabela 1. Mutacje w TEX11 wykryto w trzech próbkach uzyskanych z kohorty badania początkowego 49 mężczyzn pochodzenia europejskiego, którzy mieli azoospermię. Rysunek 1. Rycina 1. Hemizygotyczna delecja receptorów TEX11 10 do 12 i flankująca nieciągłe regiony u dwóch mężczyzn z Azoospermia.Panel A pokazuje wykres porównawczy genomowej hybrydyzacji (aCGH) chromosomu X. Po lewej stronie idiogram chromosomu X pokazuje region zainteresowania (niebieska linia) w paśmie Xq13.2. Po prawej, kropki reprezentują sondy oligonukleotydowe DNA, rozmieszczone zgodnie z ich fizycznymi lokalizacjami na mapie od dalszego ramienia p (góra) do dystalnego ramienia q (na dole) chromosomu X. Dla każdej sondy intensywność fluorescencji sygnału testowego względem sygnału odniesienia jest przekształcana do wartości logarytmicznej (log2) i pokazana wzdłuż osi x. Sondy o stosunku log2 skupionym wokół zera (czarne kropki) wskazują segmenty DNA z normalną liczbą kopii. Pozytywny stosunek log2 (powyżej +0,3 [czerwone kropki]) wskazuje na wzmocnienie (dodatkowy egzemplarz) regionu chromosomalnego, podczas gdy interwały z ujemnym współczynnikiem log2 (poniżej -0,5 [zielone kropki]) oznaczają stratę (skreślenie) w kopii DNA numer. Panel B pokazuje powiększony widok usuniętego regionu wykrytego przez 12 sond przy użyciu macierzy całego genomu 400K (obszar z szarym obszarem). Współrzędne genomowe (montaż GRCh37 / hg19) rozpoczynają delecję w 69.956.055 i zatrzymują się na 70,045,530 nukleotydach. Panele C i D pokazują, że wykres aCGH mikromacierzy X-chromosomu X-chromosomu XK o wysokiej rozdzielczości precyzyjniej wyznacza odstępy delecji w Pacjentach i 3. Chromosomowe zmiany sugerujące homozygotyczną lub heterozygotyczną delecję są wskazane przez odpowiednio brązowe i czerwone kropki. [hasła pokrewne: usg tarczycy Warszawa, rewitalizacja pochwy, wysiłkowe nietrzymanie moczu ]

Powiązane tematy z artykułem: rewitalizacja pochwy usg tarczycy Warszawa wysiłkowe nietrzymanie moczu

Posted by on 16 czerwca 2018

Pierwotne przeciwciało wykrywano przy użyciu drugorzędowego przeciwciała (rozcieńczenie 1: 250 sprzężonego z peroksydazą chrzanową przeciwciała przeciwrakowego z kurczaka, sc-2984, Santa Cruz Biotechnology). Barwienie wizualizowano przy użyciu 3,3 -diaminobenzydyny (D4168, Sigma-Aldrich) i hematoksyliny jako kontrastu. Modelowanie TEX11
Serwer przewidywania struktury białek (PSIPRED), 15 serwerów homologii, wykrywania i prognozowania struktury (HHpred), 16 i serwer przewidywania struktury białka i funkcji (I-TASSER) 17 zastosowano do przewidywania struktury drugorzędowej białka. Wykorzystaliśmy bazę danych Pfam18 do wyszukania domen białkowych w TEX11. Metodę TPRpred19 zastosowano do identyfikacji regionów powtórzeń tetratricopeptide (TPR) w białku. Aby zwizualizować trójwymiarową strukturę TEX11, zastosowaliśmy algorytmy Phyre215 i I-TASSER.17,20 Modele konstrukcyjne wygenerowano za pomocą systemu Molecular Graphics System (Schröding er) firmy PyMOL (patrz sekcja Metody w Dodatkowym dodatku).
Wyniki
Badanie genetyczne aCGH
Tabela 1. Tabela 1. Mutacje w TEX11 wykryto w trzech próbkach uzyskanych z kohorty badania początkowego 49 mężczyzn pochodzenia europejskiego, którzy mieli azoospermię. Rysunek 1. Rycina 1. Hemizygotyczna delecja receptorów TEX11 10 do 12 i flankująca nieciągłe regiony u dwóch mężczyzn z Azoospermia.Panel A pokazuje wykres porównawczy genomowej hybrydyzacji (aCGH) chromosomu X. Po lewej stronie idiogram chromosomu X pokazuje region zainteresowania (niebieska linia) w paśmie Xq13.2. Po prawej, kropki reprezentują sondy oligonukleotydowe DNA, rozmieszczone zgodnie z ich fizycznymi lokalizacjami na mapie od dalszego ramienia p (góra) do dystalnego ramienia q (na dole) chromosomu X. Dla każdej sondy intensywność fluorescencji sygnału testowego względem sygnału odniesienia jest przekształcana do wartości logarytmicznej (log2) i pokazana wzdłuż osi x. Sondy o stosunku log2 skupionym wokół zera (czarne kropki) wskazują segmenty DNA z normalną liczbą kopii. Pozytywny stosunek log2 (powyżej +0,3 [czerwone kropki]) wskazuje na wzmocnienie (dodatkowy egzemplarz) regionu chromosomalnego, podczas gdy interwały z ujemnym współczynnikiem log2 (poniżej -0,5 [zielone kropki]) oznaczają stratę (skreślenie) w kopii DNA numer. Panel B pokazuje powiększony widok usuniętego regionu wykrytego przez 12 sond przy użyciu macierzy całego genomu 400K (obszar z szarym obszarem). Współrzędne genomowe (montaż GRCh37 / hg19) rozpoczynają delecję w 69.956.055 i zatrzymują się na 70,045,530 nukleotydach. Panele C i D pokazują, że wykres aCGH mikromacierzy X-chromosomu X-chromosomu XK o wysokiej rozdzielczości precyzyjniej wyznacza odstępy delecji w Pacjentach i 3. Chromosomowe zmiany sugerujące homozygotyczną lub heterozygotyczną delecję są wskazane przez odpowiednio brązowe i czerwone kropki. [hasła pokrewne: usg tarczycy Warszawa, rewitalizacja pochwy, wysiłkowe nietrzymanie moczu ]

Powiązane tematy z artykułem: rewitalizacja pochwy usg tarczycy Warszawa wysiłkowe nietrzymanie moczu